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Overview
BDRhapsody™シングルセル解析システムには、BD Rhapsody™スキャナーとBD Rhapsody™Expressシングルセル解析システムが含まれています。
BD Rhapsody™Express シングルセル解析システムは、独自の細胞に優しいマイクロウェル単離技術を用いて数百から数千ものシングルセルをキャプチャーしバーコード化することでゲノム及びプロテオミクス解析を可能にします。
BD Rhapsody™ Scannerを使用して、シングルセルに単離するための各実健ステップを確認しながら慎重に失敗のないシングルセル解析をしていただけます。貴重なサンプルをご使用になる場合や、どれくらいのデータ量を取ればよいかまたシークエンスに進むかどうかの判断材料としてご使用いただけます。
BD Rhapsody™ Expressシングルセル解析システムはパワフルなマイクロウェルベースのシングルセル単離システムです
- 液体ポンプを使用しない、小型のベンチトップ・シングルセル単離システム
- 重力による自然落下によるマイクロウェルへの単離により細胞に優しい処理が可能
- 各BD Rhapsody™カートリッジには、220,000を超えるパーティションを持つマイクロウェルアレイが含まれています
- BD Rhapsody™カートリッジの容量は約600µLです。 希釈細胞懸濁液は、少量に濃縮することなく、カートリッジに直接ロードできます
- マイクロ流体チャネルを使用していないため、チャネルが細胞で詰まる心配はありません
- マイクロウェルは、細胞が表面に付着するのを防ぐために特殊な加工がされていて、しっかりとQCが実施されています
BD Rhapsody™シングルセル解析システム用の安定した磁気バーコードビーズにより、柔軟な実験計画を立てることができます
- BD Rhapsody™ビーズはワークフロー全体を通して安定しています
- cDNA分子を含むビーズは数ヶ月間保存することができます
- ビーズは、複数のシーケンス・ライブラリを作成するために分けてご使用いただけます
- 保存されたビーズは実験を効率化できるようにプールして同時にシーケンスできます
- 容易に共同研究者と保存されたビーズを共有することができます
- パフォーマンスの標準化とSOP改善に役立ちます
最大12週間保存されたビーズから得られたデータによる遺伝子発現の高い相関と最小限のバッチ効果。
BD Rhapsody™シングルセル分析システムは、トランスレーショナル・リサーチ、多施設、大規模コホート研究に理想的なシステムです
マイクロ流路技術を使用しないため、自然重力による優しい細胞単離が可能になり信頼性と再現性に優れた結果を得られます
- Technical replicates結果で最小限のバッチ効果
- Biological replicates結果で最小限のバッチ効果
- サイト間のばらつきを最小限に抑える
- ユーザー間のばらつきを最小限に抑える
- 最小サンプルバイアス
- バッチ効果を修正せずに大規模なデータセットを統合する機能
Technical ReplicatesとBiological Replicates間、およびユーザーとサイト間で見られる遺伝子発現の高い相関
BD Rhapsody™スキャナーは、シングルセル化の各ステップを確認できる機能のついた可視化ツールです
Analysis
Number of wells with viable cells at cell load 9118 |
Cell multiplet rate at cell load 2.4% |
Number of wells with viable cells and a bead 7999 |
Cell multiplet rate 2.0% |
Bead loading efficiency PASS |
Cell retention rate PASS |
Bead retrieval efficiency PASS |
Excess bead rate PASS |
PERFORMANCE
BD Rhapsody™シングルセル解析システムは、信頼性と再現性のある結果を提供し、トランスレーショナル・リサーチに理想的なシステムです
このシステムは、他のシステムと比較して、さまざまな細胞タイプで優れた細胞キャプチャー率と低いマルチプレット率を可能にします
カートリッジ間での全てのmRNAとタンパクマーカーの高い相関
同様なBiological replicatesデータ
サブサンプリングされたビーズからの同等のデータ
サブサンプリングされたビーズからの同等のデータ
BD Rhapsody™シングルセル解析システムは表面タンパク質とmRNA発現を同時測定することで、制御性T細胞の異なるサブセットの識別を可能にします
CD45RAおよびHLA-DRでソートされたTregサンプルの手動ゲーティングおよび二変量解析に基づいて特定された3つの主要なTregサブセットに対し、差次的遺伝子発現および差次的タンパク質発現解析をした。遺伝子発現解析には、BD Rhapsody™Targeted Human Immune Response Panel(399遺伝子)を使用した。高発現した遺伝子(>1.25X)はヒートマップに示されている。
BD®AbSeqオリゴ・コンジュゲート抗体を使用して、22種類のタンパク質発現も同時に解析された。
The BD Rhapsody™ シングルセル解析システムを用いた疲弊T細胞の特性評価
CD8 + T細胞への慢性的刺激の14日目に有意義に高発現した12種のタンパクおよび遺伝子発現を示すヒートマップ。2つの細胞集団(赤と緑のボックス)が確認された。
CD38, CD39 , CD94において共発現が認められた。
BD Rhapsody™シングルセル解析システムで、自然リンパ球の不均一性を解明
シングルセルレベルでのタンパク質および遺伝子発現の差異を示すヒートマップ。主要なILCサブセットに不均一性が示されている。
BD Rhapsody™シングルセル解析システムでCLLサンプル内の不均一性を特定
mRNAとタンパク質の同時解析により詳細な細胞集団クラスターが示されている。健康なドナーからのサンプル間でも同様なクラスターが示され、CLLサンプルではそれぞれに特有なクラスターが確認された。
- Brochures
- User Guides
- Data Sheets
- A Comprehensive Characterization of Regulatory T Cells Using the BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System
- Assessing Obesity-Induced Inflammation in Mice through Single-Cell Multiomic Analysis
- Exploring Tumor Heterogeneity of Chronic Lymphocytic Leukemia Using Single-Cell Multiomics
- Resolving Human Circulating Innate Lymphoid Heterogeneity Using Advanced Single-Cell Multiomic Analysis
- Single-Cell Multiomic Analysis of T Cell Exhaustion In Vitro
- Streamlined Transfer of High-Parameter Flow Cytometry Panel from Cell Analyzer to Cell Sorter Prior to In-Depth Single-Cell Multiomic Analysis of Murine Lymphocyte Subpopulations
- Leveraging the Power of High-Parameter Cell Sorting and Single-Cell Multiomics to Profile Intratumoral Immune Cells in a Model of B-Cell Lymphoma
- Presentations
- CLL Phenotyping with BD Rhapsody™ Targeted Panels and BD® AbSeq Assays
- Single-Cell Multiomic Analysis for Deep Characterization of Exhausted T Cells
- Single-Cell Multiomic Analysis of Immune Cells in Obese Mice
- One Solution for Comprehensive Treg Characterization Via Single-Cell Multiomic Analysis
- Single-Cell Multiomic Analysis for the Resolution of Innate Lymphoid Cell Heterogeneity
- Protocols
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For Research Use Only. Not for use in diagnostic or therapeutic procedures.
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Dynabeads is a trademark of Thermo Fisher Scientific.
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